蔡巴寺，藏文tshal gung thang，又称扬贡寺，位于今拉萨以东，拉萨河南岸蔡公堂乡，距离拉萨市区10公里，它与贡塘寺合称为蔡贡塘寺，两座寺院都曾是蔡巴噶举派的主寺，两座寺院南北相对，相距只有0.5公里。蔡巴是地名，位于今拉萨市东郊，全名蔡贡塘，居住在蔡贡塘的人也称为蔡巴。

当时，蔡巴地区是忽必烈的份地，有个自称是噶尔东赞后裔的家族势力非常强大，家族领袖是噶尔·嘉哇迥乃与尊追扎巴结为供施关系，噶尔家族不断地扩大自身势力范围，逐渐统一了拉萨地区，他的后嗣也得到了元朝的支持。

公元1151年，尊追扎巴和帕珠·多结嘉布前往岗布寺拜谒塔波拉杰，多结嘉布成了塔波拉杰的弟子，而尊追扎巴只能随塔波贡巴·次程娘布学法，成为塔波拉杰的再传弟子。公元1175年，尊追扎巴遵照塔波贡次的意思和在拉萨地区蔡巴庄园的首领噶尔·嘉哇迥乃的支持下，在拉萨东南约10公里处的蔡巴建造了扬贡寺，通称为蔡巴寺。

公元1187年，尊追扎巴又修建了贡塘寺，还造了一尊大佛像；他为了抢掠财物，扩大自己的势力范围，经常制造内乱，直到堆松钦巴从康区赶来劝告，他才停止这种争斗抢掠的行为。对于他的这种行为，外界是褒多于贬，甚至有人认为这是弘法的需要，是无可非议的。“由于需要，他常制造争斗，一些凡夫俗子认为这是造罪”（《土观宗派源流》）。

蔡巴寺、贡塘寺的住持由一个人同时担任，尊追扎巴去世后寺院的住持情况在藏文史料中记载都不一样。

据第5世拉萨活佛在《西藏王臣记》中记载：尊追扎巴的近侍达玛循努被认为是帝释天的化身，他在修建贡塘寺时出力最多，尊追扎巴去世后，就委托他为两寺的住持。有的史书记载：因为达玛循努擅长政务，所以他把寺院交给他人，自己去担任地方官。

在《青史》、《红史》的记载：蔡巴寺和贡塘寺的第1任住持是尊追扎巴的弟子娘曼释迦益希，他从公元1187——1207年担任住持21年；第2任住持是强久益希，生卒年不详，任职时间是公元1208年——1210年；第3任住持是尊追扎巴的大弟子拉曲喀瓦·尼达沃，任职时间公元1211年——1214年；第4任住持是桑杰本，生卒年不详，任职时间公元1214年——1231年，长达16年；第5任住持是桑杰娘布，生卒年不详，任职时间公元1231——1237年，他是娘曼释迦益希的侄子；第6任住持是桑杰循努，生卒年不详，在位时间公元1238年——1260年，在位共23年；第7任住持是阿阇梨夏仁的儿子贡嘎坚参，生卒年不详，任职时间公元1260年——1292年，长达33年；第8任住持是阿阇梨释迦沃的儿子桑杰仁钦，生卒年不详，任职时间公元1292年——1301年；第9任住持是释迦本，任职时间是公元1301年——1310年，他是桑杰仁钦的远亲；第10任住持是强久贝桑布仁波切，任职时间公元1310年——1356年，任期长达46年，他是桑杰仁钦姐姐的儿子；之后由京俄·扎巴西年等人次第担任住持。

蔡巴噶举派是在蔡巴地区的噶尔家族扶持下发展起来，自从，蔡巴噶举派与噶尔家族结为供施关系后，他们用武力和宗教影响，不断的扩大势力范围，逐渐兼并了拉萨其它地区的地方势力的地位，使整个拉萨地区趋于统一。

在噶尔·嘉哇迥乃的儿子桑杰顿珠出任地方官时，元朝分封卫藏各地方势力为万户，蔡巴就已经是相当具有实力的政教合一的地方势力集团，随后被划分为十三万户之一，桑杰顿珠出任第1任蔡巴万户长。

蔡巴地区原是忽必烈的份地，蔡巴噶举派曾遣使者到蒙古地区寻求靠山，忽必烈赐属民数万户，在划分十三万户时又划归了数千户属民。

桑杰顿珠的儿子仁钦坚参曾亲自进京朝贡，忽必烈赐给他金印、诰命、土地和属民。仁钦坚赞有3个儿子：长子尼玛喜饶，曾随八思巴进京见过元世祖，接受过封号、诰命；次子噶德衮布，相传他曾7次前往内地，仗着背依中央政府的背景，在地方上颇具势力，他还把内地的刻板印刷技术带回了西藏，对西藏学术、文化起到了促进的作用；幼子仁钦旺秋，出家僧人。

接着，蔡巴噶举派的实权就真正落入了噶尔家族的手上，蔡巴噶举也正式沦落为政治的附属品。作为政教合一的地方势力集团，蔡巴噶举派在拉萨地区的发展演进的历史起到过重要作用，也有过不少的建树。从尊追扎巴开始，蔡巴噶举派的后嗣及历任万户长，除了管理扩建、新建蔡巴噶举派的寺院外，还长期有条不紊地管理过大昭寺、翻修大昭寺。

蔡巴·贡噶多杰（西藏历史上的著名人物），公元1309年出生，父亲是蔡巴万户长仲钦默兰多杰；公元1327年，他受任为万户长，次年进京朝觐皇帝，得到了丰厚的赏赐和万户长的诏书，共担任蔡巴万户28年，在职期间保护、修缮了蔡巴寺、贡塘寺、大昭寺和布达拉宫等，修建了日邬格培斯，还曾迎请布敦·仁钦朱校勘那塘版《甘珠尔》等藏区的所有经藏，以金银汁书写、编辑了260余部红籍的《蔡巴甘珠尔》，被藏族学者尊为范本。

蔡巴·贡噶多杰曾联合萨迦万户、雅桑万户，共同和帕木竹巴作战，后来他们被帕木竹巴击败，使得蔡巴的辖地全部被帕木竹巴夺走，自此，蔡巴一蹶不振，蔡巴万户府也就名存实亡了。

公元1352年，贡噶多杰把万户长一职交给弟弟扎巴喜饶，他自己选择出家受比丘戒，法名格微洛追（善慧），第4世噶玛巴从内地返回西藏时，被格微洛追迎请至蔡巴寺，讲授多种经论。

蔡巴·贡噶多杰是一位知识渊博的大学者，被誉为“遍知司徒”，以编纂《甘珠尔目录》而闻名，后来的《甘珠尔》刻本是以他编纂的《甘珠尔目录》为蓝本刊行，他的著作有讲述蔡巴噶举派历史的《白史》，讲述王统传承的《花史》、《贡塘喇嘛传记》、《先父默兰多杰传记》、《红史》和《红史续集》，以《红史》最出名。

贡噶多杰的儿子格雷桑布也接受过元朝授予的“司徒”封号，他的子孙在明朝仍有“都指挥使”的官衔，但没有实权。

作为政教合一的蔡巴噶举，政务方面由噶尔家族的子孙承袭万户长一职，掌握政教大权；教务方面由尊追扎巴的后嗣担任住持，管理和护持寺院，蔡巴噶举派就没有采取活佛转世制度，没有像噶玛噶举派形成有巨大影响力的活佛转世传承。随着，蔡巴万户的失势，作为教派蔡巴噶举也日渐衰微直至绝传。

在元末时期，蔡巴寺、贡塘寺改为桑普寺的属寺，在格鲁派兴起后，拉藏汗把蔡巴寺敬献给第50任甘丹赤巴——根登彭措（更敦彭措），藏文Gendun Puntsok，也是第1世贡唐仓活佛，他后来把蔡巴寺改宗为格鲁派。

后期，蔡巴寺不幸被毁，我们现在看到的蔡巴寺是1950年后，重新修建的建筑。

重建后的蔡巴寺的规模比之前的小，原来的措钦大殿有4根长柱，36根短柱，现在的措钦大殿有4根长柱，8根短柱，措钦大殿后面及两侧的佛殿原来供奉的是2尊佛陀像，1尊向·尊珠扎巴像，还有药师佛、先知王、宣法海、边善胜详、纯金无垢、妙音王、妙相普宣吉祥镀金铜像、35尊忏悔佛（释迦佛与35佛一起坐禅，对凡是有五无间的罪人展开忏悔、训化的场景）等像；殿内原存放的金、银、墨书写的《甘珠尔》、唐卡，如今都已不再。

蔡巴寺的3座附属寺院：

伟林寺，又称伟林扎仓，由仲钦·嘎第白修建，位于蔡巴寺西南约150米，卫林寺是2层藏式建筑，经堂有2根长柱，20根短柱，经堂后面有3座神殿，中间供奉三世佛、无量寿佛、药师佛，西侧佛殿供奉四臂依怙神等，东侧佛殿供奉护法神等。

乃琼寺，又称乃琼殿，位于蔡巴寺东北约80米处，1层建筑，主供琼和两位护法神。

居敏寺，位于蔡巴寺西南约500米处，2层藏式建筑，措钦大殿有42根立柱，后面是佛殿，这里曾是拉萨上密院、下密院的前身，后改为上密院、下密院的属寺。