香巴噶举派，藏文shangs-pa-bkav-brgyud，是噶举派两大传承系统之一。香巴噶举派的创始人琼波南交，藏文kyung-po-rnal-vbyor，公元990年-公元1140年（生卒年，还有另一种说法是公元1086年-？）。

“琼波南交”意为琼波族的瑜伽行者。琼波南交曾七次赴印度去求法，并接受「口传心受」的密法。在琼波南交返回西藏后，在后藏的香地（今西藏南木林县）建了以香寺为主的多座寺庙、神殿，及广收门徒，最终创立了香巴噶举派。

之后，香敦•楚臣贡布在香地的北面修建甲寺（即葭寺）藏文vjag，在今西藏南木林县；克准•迅努朱修建桑丁寺，藏文bsam-idjngs，在今西藏朗卡子县。香巴噶举派逐渐形成了以“甲”、“桑”两个支派。

桑丁寺住持传到多吉帕母时，建立了西藏的「女活佛」制度传承，宗教地位很高。

在公元15世纪时，以修「铁索桥」和「创立藏戏」闻名的唐东杰布，也是香巴噶举派的僧人，也充分表明香巴噶举派的教法，曾在前藏的曲水一带流传。

格鲁派的宗喀巴尊者及其弟子克珠杰都曾向香巴噶举派的僧人学法。

公元15世纪以后，香巴噶举派的影响渐小。