萨迦巴，藏文sa skya pa，简称萨迦，藏文sa skya，它是萨迦派第五祖八思巴，借助元朝廷的政府机制，在全西藏建立了一个隶属于元朝廷的政教合一的自治政权，这也是西藏历史上各教派统治时期的第一个政权，史称“萨迦王朝”。

萨迦巴政权从公元1253年八思巴掌管萨迦派算起，在公元1358年失势于帕木竹巴政权，萨迦巴共持续了105年。

在萨迦巴出现之前，西藏经历了300多年的独立发展时期，在政治上各部落各自为政，在文化上呈现了一个百家争鸣的时代，它对西藏未来的历史，产生了巨大的影响，藏传佛教也正是在这个时期，成了主导整个西藏的宗教。

公元1240年，蒙古帝国第二次西征，蒙古大汗窝阔台的皇子-阔端派遣大将多达那波率军深入西藏，详细了解西藏的政治形势和各教派的情况。

公元1244年，萨迦派第四祖萨迦·班智达受到阔端的邀请，前往凉州。

公元1247年，萨班与阔端会晤，由此开启了藏传佛教与蒙古之间的直接交流，史称凉州会盟。

公元1251年，萨班去世，不久后，阔端也去世了。

公元1251年，阔端之子蒙哥带领八思巴，前往六盘山与蒙哥之弟忽必烈见面，八思巴不仅向忽必烈讲授佛法，而且还为他解答了很多问题，使忽必烈对佛法产生了虔诚的信仰。

公元1253年，八思巴成了萨迦派的新教主后，一直跟随忽必烈。

公元1254年，八思巴受赐“优礼僧人诏书”。

公元1260年，忽必烈在开平（即元上都）自立为汗，随即册封八思巴为国师，赐玉印、任中原法王，统领全国的佛教。

公元1263年，八思巴归返西藏，临行前被封为藏区政教之主，受赐珠宝册印。

公元1264年，忽必烈击败了阿里不哥后，随即下诏设立『总制院』，令八思巴以国师的身份兼领该院的院事。

『总制院』（公元1288年后改为宣政院）是直属中央政府的国家机构，下面设有三个“宣慰使司都元帅府”（即吐蕃等处、吐蕃等路、乌思藏宣慰司），负责掌管全国佛教事务和处理管辖整个西藏的军政事务，宣慰使司下面还置有管理民政的万户府、千户所，还设有院使、同知、副使等官员，下辖西藏的各级地方行政机构，包括宣慰司、安抚司、招讨司、万户府、元帅府等。『总制院』的设立开创了宗教领袖统治西藏地区之始。

藏传佛教在忽必烈的推崇下，在当时的社会与政治上都有极高的地位，之后的诸位元帝，都受藏传佛教的戒律，还将藏传佛教推广到了蒙古的各部。

八思巴还根据忽必烈的要求，按照藏文字母的拼音方式创造了“八思巴文”

公元1270年，八思巴为忽必烈灌顶，忽必烈为了报答他的灌顶之恩和造字之功，晋封他为帝师；忽必烈还通过八思巴的举荐，任命了总管西藏事务的行政长官和13个万户长。

公元1271年，忽必烈（元世祖）改国号为『大元』，正式建立了元朝。

公元1279年，忽必烈消灭了南宋，统治全中国。

此时，原蒙古帝国已经分裂出元朝和四大汗国，他们各自为政，原蒙古帝国已不复存在。

西藏被元朝廷设立的宣政院管辖，一方面在忽必烈及之后的各元帝的大力支持下，宣政院的职权一直由萨迦派所掌握，负责统治整个西藏 ，另一方面元朝廷在政治上控制着西藏，在文化和其他层面上又受到了西藏的影响。

元朝廷与萨迦派的关系是互利互惠的，元朝廷多次派遣官员进藏，在萨迦本钦的配合下，清查了西藏各地区的户口，确定各万户的贡赋，还设立了驿站及保证驿站交通的乌拉差役制度，在这个基础上，元朝廷还在西藏驻扎军队，设有各级官府，以确保元朝廷中央政府对西藏的统治和政令的推行。

元末元顺帝中后期，汉地的局势混乱，而萨迦派在西藏的领导地位，也受到了帕木竹巴的挑战。在萨迦巴统治的部落中，以止贡、帕竹和蔡巴三个万户长辖区地广人众，占有举足轻重的地位。

萨迦巴历任统治者

公元1358年，帕竹首领-绛曲坚赞攻打萨迦，废除了最后一任萨迦本钦，并成功控制了西藏的大部分地区，由此宣告结束萨迦巴统治西藏的时期。