本尊，藏文yi-dam，梵文samadani，意为“本有而于出世间为最胜最美”。因为在诸尊中以其尊为本而尊崇，所以称“本尊”。
据《大日经·本尊三昧品》记载：“本尊者有字、印、形三种：字’ཨཎ’等之种子也；印者金刚杵、羂索之三昧耶形也；形者相好具足之尊形也”。
藏传佛教的密宗修行者，必须供奉观想的神。大多形象呈忿怒相、怖畏形，表示神佛以其威慑怖畏的威猛力，摧破降伏种种恶魔，使众生从“无明”中解脱出来，其神称为“忿怒明王”、“金刚”。明王是佛陀或菩萨的变相化身，以其忿怒变相，来表示「缘起大悲」而示现威猛。
此图是19世纪，汉藏风格，大威德金刚单身相唐卡。主尊居中，九面三十四臂十六足，正面是水牛头，面生三目，象征阎罗王。顶上饰有文殊菩萨相，象征智慧与力量，其余为忿怒相。每手各执不同的法器。足踏飞禽走兽护法天神之上，以舞立姿站立在五色莲花宝座上。大威德金刚是藏传佛教无上瑜伽续部的重要本尊之一，被认为是文殊菩萨的忿怒相化身，深受藏传佛教各派和信徒的信奉，在格鲁派中尤为重视，是格鲁派的三大本尊之一。本尊神分为单体、双体像，双体像称为“双尊像”、“双身佛”或“欢喜佛”，呈现为男女拥抱交媾状。男身代表法，女身代表智慧，男体与女体相互紧拥，表示法与智慧双成，相合为一人，喻示法界智慧无穷。“欢喜”在教义中并非是淫乐，而是指大无畏，凶猛的力量。依据藏密的说法，藏密修行者，必须通过“身、口、意”的“三密”感应，依照“三密”的样板，坚持净除自己“身业、口业、意业”的“三业”，才能修成“佛身圆满”，而达到“即身成佛”。
藏传佛教密宗中的本尊主要有（无上密乘的五大金刚或五大明王），即：
此图是18世纪，格鲁派传承，大威德金刚双身相。1、大威德怖畏金刚；
此图是18世纪，上乐金刚唐卡。主尊居中，拥抱明妃，主尊身蓝色，明妃身红色。上乐金刚密无上瑜伽部母续的本尊，是三世诸佛的金刚身、语、意所依，是诸佛功德的总集代表，也是藏密无上瑜伽修法中尊奉的五大本尊之一，又称为总集轮。虔诚供奉修持上乐金刚，清净了一切众生身、语、意的细分业障。得诸佛的功德加持和句义灌顶，堪能成就佛的功德，开显平等性智，速证佛的自性身。在无上密续中，属于母续法，上乐金刚也被尊称为母续之王，是亿万空行总主。2、胜乐金刚（又称上乐金刚）；
此图是19世纪，安多强巴风格，时轮金刚唐卡。主尊居中，四面十二臂，忿怒相，头戴骷髅冠，发髻高耸，上饰月牙，十字杵；裸身，身披璎珞，拥抱明妃，其余各手分执法器；舞立姿，脚下踩红色欲望神、白色恐怖妖魔，下承五色莲花宝座。时轮金刚是藏传佛教密宗无上瑜伽部本尊，是格鲁派的五大金刚之一。时轮金刚像代表十方一切佛菩萨以及显密佛教的总体，是真理最完美绝妙的显现。据《西藏王臣记》等典籍记载，他来源于古印度北方的“香巴拉国”，约于公元12世纪时传入西藏，成为藏密无上瑜伽修法中所奉重要的本尊。3、时轮金刚；
此图是18世纪，密集金刚唐卡。主尊居中，蓝色双身，三面六臂，忿怒相。主尊身深蓝色，每面颜色不一，发髻装饰奢华。双手置于胸前结金刚吽迦罗印，并执金刚铃、金刚杵，其余右手分执法轮、莲花，左手执摩尼宝、宝剑。拥抱明妃，跏趺坐。明妃三面六臂，身为青灰色，手中持物和主尊相同。密集金刚，代表“三世诸佛之身语意三密无别或聚集”之意，是密集金刚系列中不动金刚化现出来的形象，是无上瑜伽父续的本尊，广受尊崇。4、密集金刚（又称集密金刚、聚密金刚）；
此图是19世纪，藏东风格，喜金刚唐卡。主尊居中，八面十六臂二足，每面三目，獠牙交错，头戴骷髅冠，黄发束髻，项戴五十人头项链。每手都托一个骷髅碗，碗中分别站立着不同的神兽。左腿屈，右腿伸，抱着黄发三目、头骨为珞、右手持月刀、左手持颅碗的明妃“金刚无我佛母”，威立在莲花宝座上，脚踩仰卧人。喜金刚是密宗无上瑜伽部母续尊奉的重要本尊，也是萨迦派道果修法尊奉的主要本尊。5、喜金刚（即欢喜金刚）。
另外，还有玛哈玛亚、金刚勇识（又称金刚萨埵、金刚手等，是密乘百部本尊神的共主）、金刚界佛、底哩三昧耶佛、九尊马头明王、诸忿怒明王等。
