如来藏学派，旧称“如来藏缘起宗”、“法性宗”，与中观派、唯识派，组成了大乘佛教的三大派别。如来藏学派主要宣扬如来藏常住的学说，以《胜鬘经》为代表。如来藏学说与唯识学说融合后，出现了如来藏唯识学说，以《楞伽经》、《密严经》为代表。汉传佛教以「如来藏学派」为主流，藏传佛教也受到了影响。

公元2～3世纪，如来藏学派在南印度兴起，随后扩展到全印度，成为大乘佛教后期的主流。如来藏学派与中观、瑜伽二派之间，有着极为紧密的互动，彼此互相影响。因为如来藏学派的论师与论书较少，在此派的论书中，大量的引用其他宗派教说，经过重述后来支持自身的宗义，如来藏学派曾一度被隐藏在中观、瑜伽二宗派之下；但是现代佛教都已肯定了如来藏学派的独到见解，将它分立为大乘佛教的第三个宗派。

如来藏学派主张一切法空是不了义，以如来藏“常乐我净”为主要宗义。因为此学派的立场，常被中观、瑜伽二派认定是真常论者、有我论者，在佛教内受到了一些批评。瑜伽行唯识学派采纳了如来藏的部分学说。般若学派主张一切法空为了义，而中观派学者认为如来藏是非了义说，以反对如来藏的实有，中观学派也受到如来藏学派的许多影响。现在的瑜伽行唯识学派与中观学派，都认为如来藏学派是不了义说。

如来藏学派擅长融会贯通，它圆融的态度，在汉传佛教中得到了高度认同，也深深影响了大乘佛教的发展。在中国-唐武宗灭佛后，受如来藏学派深刻影响的禅宗，则成了汉传佛教的主流。

在藏传佛教中，无论是旧译派的大圆满传承，还是新译派的大手印传承，都以人人本具如来藏作为教义核心。透过藏传佛教的影响，如来藏学派也在藏传佛教中奠定了根基。

早期的如来藏学派经典中，只有对如来藏常住的探讨，并没有与唯识学派的结合。唯识学派的经典，与如来藏学派之间有着紧密的关联。在《楞伽经》集成后，唯识学派的理论与如来藏的理论相融合。《楞伽经》中将如来藏的思想，与唯识思想会通，也与般若学派的一切法空会通。
在护法、清辩等人诤论“空有”的时代，如来藏学派与唯识派合流，形成了唯识古学与今学之争。在戒贤与智光诤论”性相”的时代，如来藏学派又与中观学派合流，形成了”顺瑜伽行中观派”等派别，之后又引起了中观派中，对自性空与他性空的诤论。

如来藏学派在《楞伽经》、《密严经》中，阐述了如来藏缘起学说，又称真如缘起，即由如来藏之自性清净心生起一切万有。如来藏有常住不变之一面，同时也有随缘起动而变现万有之一面，先是如来藏之一心，被无始以来之无明恶习所熏习，成为第八识-阿赖耶识（即藏识），再由藏识现起万有，如来藏的本性不被毁损，并形成“如来藏为体，藏识为相”的关系。《大乘起信论》将它归纳为”心真如门”、”心生灭门”。

公元3世纪末期起，如来藏的典籍陆续传入汉地。在汉传佛教的各宗派或多或少，都受到了如来藏学派的影响：

1、三论宗，吉藏曾为《胜鬘经》、《大般涅槃经》作注解。2、涅槃宗，修习《大般涅槃经》。3、地论宗，修习《宝性论》和《大乘起信论》。

• 相州北道派，主张九识说，认为第八识是妄识。
• 相州南道派，主张八识说，认为第八识是真识。

4、摄论宗与相州北道派合流后，受到《大乘起信论》的影响。

5、天台宗，智𫖮以圆融三谛，取代二谛。

6、禅宗，早期尊奉《楞伽经》，后来注重《楞严经》。

7、唐密，传承者将真言宗、天台宗对心性本净，采用如来藏来释义。

藏传佛教对如来藏的见解，认为如来藏实有，主张他空见；另一派为顺假相唯识派，又称妄心派，主张如来藏缘起，持自性空见，认为阿赖耶识是如来藏。在中观学派中，藏传佛教前弘期以顺瑜伽行中观派为主，主要的传承是宁玛派、萨迦派。在公元12世纪时，觉囊派的传承来自时轮派，即主张如来藏实有的他空见，与当时的格鲁派教义产生了争议。在公元17世纪中叶，格鲁派掌握西藏政权后，觉囊派即遭到禁止。