木里土司是明、清朝时在四川西南设置的世袭土司，位于今四川凉山彝族木里县。木里原是永宁土司的领地。

格鲁派的蔡木多活佛来到永宁弘法时，永宁土司将木里赠送给了蔡木多活佛，之后，木里一直是由格鲁派的活佛统治。

木里土司的祖先原是瓦尔寨大寺的僧人。

公元1648年，降央绒布受清朝廷册封，以僧人的身份兼任土司。

公元1729年，设立木里安抚司，将土司－六藏涂都设为安抚使，并赐项氏姓，他的后裔都以僧人的身份兼任土司，共传了21代土司。

因为木里境内的金矿资源丰富，所以使得木里土司非常富有。

1952年，正式废除木里土司，改设为自治区。

1953年，改为自治县。

美籍奥地利探险家－约瑟夫·洛克在木里考察过一段时间，期间攥写了大量的游记，他还与木里土司结下友谊。

在詹姆斯·希尔顿著述的《消失的地平线》书中描写的香格里拉，就是以木里为原型。

书中写道：

在一个长长的山谷间，两旁是圆形悲凉的矮山，而山谷前端的奇观是一座高耸的山峰，刻板得几乎是一幅天然几何图形。那是一座几乎与喜马拉雅山一样的锥形山峰，几乎是一座美妙绝伦的金字塔。在与世隔绝的大山中的喇嘛王国里，还有一个叫罗瑜的漂亮姑娘……